Install WRF on Linux OS. Part 1 - Установка модели WRF на Linux. Часть 1

Цель: Поставить модель WRF на Linux-дистрибутив
Средства: Ubuntu 10.04 LTS, WRF ARW model, Internet

Это первая часть "step-by-step" инструкции по установке и запуску негидростатической мезомасштабной атмосферной модели WRF версии 3.1 на ОС Linux. В ней описываются особенности сборки и компиляции двух главных компонент модели WRF: собственно WRF и WPS.  
В качестве среды Linux был использована довольно старая версия Ubuntu 10.04 LTS (Lucid Lynx). Все описанные ниже действия являются русифицированным аналогом онлайн учебника, который Вы можете найти здесь Wrf OnLineTutorial . Итак, приступим.

N.B. Библиотека Netcdf версии 4.1 была собрана без возможности использовать hdf5 (т.е. новый) формат. С установкой HDF5 возникли сложности, как и с WRF версии 3.3.
Netcdf 4.1 + WRF3.1 оказалось хорошим к установке сочетанием для этой версии Ububntu.


I.  NetCDF installing. Сборка библиотеки netcdf.


Для сборки и работы модели нужна библиотека netcdf. Скачиваем netcdf 4.1.1 , распаковываем архив в любую папку ("Загрузки", например):

gunzip  netcdf-4.1.1.tar.gz
tar -xf   netcdf-4.1.1.tar


Открываем в аналоге блокнота файл INSTALL и ... читаем =). Здесь будет использована сборка netcdf без поддержки нового формата hdf5. Для этого прописываем следующее в терминале, в директории с распакованным netcdf:

./configure --prefix=/usr/local/netcdf --disable-netcdf-4
sudo make check install 

Второе без sudo может завершиться ошибкой. Собственно конструкция --prefix= указывает путь, где будет располагаться Ваш netcdf. Обычно его ставят в  /usr/local/netcdf, но можно указать и другой путь. После правильной установки в окне терминала появится следующее:

+----------------------------------------------------------+

| Congratulations! You have successfully installed netCDF! |

|                                        ***                                          |

+----------------------------------------------------------+

Установим путь для окружения netcdf через команду export:

export NETCDF=/usr/local/netcdf

В учебнике приводится конструкция setenv. Разница между ними по синтаксису в нашем случае такая:

setenv VAR /path1/path2
export VAR=/path1/path2

Всё, с netcdf худо-бедно разобрались.

II. WRF configure & compile. Сборка WRF.

Быстро зарегистрировавшись, загружаем модель (WRF 3.1) и соответствующую ей по версии систему предварительной обработки (WPS 3.1)  с Get_wrf3.1_sources . 

Создаем папку  в домашней папке и копируем туда архивы: 

pwd  

   /home/user/

mkdir WRF 

Разархивируем оба архива в новую папку WRF:

gunzip  WRFV3.1.TAR.gz
tar -xf  WRFV3.1.TAR
gunzip  WPSV3.1.TAR.gz

tar -xf   WPSV3.1.TAR


После разархивации появятся две папки: WRFV3 и WPS. Сначала соберём сам WRF. Для этого заходим в папку WRFV3:

cd WRFV3

Определяем параметры сборки. Пишем в терминале:

./configure

В открывшемся меню выбираем 1 (gfortran serial) и 1 (basic). Далее стоит (но необязательно вроде как) указать путь для поддержки крупных по размерам файлов (система сама подскажет насчёт этого). Сделаем это:

export WRFIO_NCD_LARGE_FILE_SUPPORT=1

Всё, мы готовы компилировать:

./compile

Если всё хорошо, то далее

./compile em_real >& compile.log

Если в итоге в папке main появились exe-шники real.exe wrf.exe, значит всё получилось!


III. WPS configure & compile. Сборка системы подготовки WPS.


Собственно здесь всё аналогично. Переходим в папку WPS (cd WPS).
Важно снова указать путь для netcdf:

export NETCDF=/usr/local/netcdf

Определяем конфигурацию сборки:

./configure

Здесь использовался номер 13 (gfortran with NO GRIB2, т.к. GRIB2 требует JAVA-библиотеки JASPER, с которой были проблемы)

Собираем:

./compile em_real >& compile.log


Если всё ОК, то в папке WPS появятся ссылки на exe-шники (metgrid.exe, ungrib.exe, geogrid.exe и сами exe-файлы в соответствующих папках в /src)


Итого: мы установили библиотеку netcdf, собрали саму модель WRF и систему подготовки данных. Следующим шагом будет настройка основных параметров и запуск модели.